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因美納
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新產(chǎn)品
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北京德泉興業(yè)商貿有限公司
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illumina基因測序儀NextSeq 1000/1000-CN

所屬分類:因美納
內容摘要:illumina基因測序儀NextSeq 1000
咨詢電話:010-83659275

產(chǎn)品簡介

查看NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN測序系統(tǒng)的規(guī)格,從零開始重新設計,滿足不斷發(fā)展的需求

 
所有系統(tǒng) /測序平臺 /NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN:

每個流動槽的測序產(chǎn)出*

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN
流動槽類型 P1 P2 P3 
1 × 50 bp     60 Gb
2 × 50 bp 10 Gb 40 Gb 120 Gb
2 × 100 bp   80 Gb 240 Gb
2 × 150 bp 30 Gb 120 Gb 360 Gb
2 × 300 bp 60 Gb 180 Gb
(300 M)
 

* 輸出規(guī)格基于單個流動槽,使用Illumina PhiX對照文庫,在支持的簇密度下產(chǎn)出進行計算。
† P3試劑僅適用于NextSeq 2000/2000-CN系統(tǒng)。

 

保質期

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN
條目 儲存溫度 保質期
卡盒 -25°C至-15°C 6個月
流動槽 2°C至8°C 6個月
RSB(含Tween 20)* 2°C至8°C 6個月

* 室溫下運輸

 

每個流動槽通過過濾的read

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN
流動槽類型 P1 P2 P3 *
單端reads 100M 400M  1.2B
雙端reads 200M 800M  2.4B

* P3試劑僅適用于NextSeq 2000/2000-CN系統(tǒng)。
† 對于2 × 300 bp的測序深度,為300M單端reads。
 對于2 × 300 bp的測序深度,600M雙端reads。

 

質量分值*與運行時間

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN
流動槽類型 P1 P2 P3 
質量分值  
1 × 50 bp 在1 × 50 bp時,≥ 90%的堿基分值高于Q30
2 × 50 bp 在2 × 50 bp時,≥ 90%的堿基分值高于Q30
2 × 100 bp 在2 × 100 bp時,≥ 85%的堿基分值高于Q30
2 × 150 bp 在2 × 150 bp時,≥ 85%的堿基分值高于Q30
2 × 300 bp 在2 × 300 bp時,≥ 80%的堿基分值高于Q30
運行時間  
1 × 50 bp     約11小時
2 × 50 bp 約10小時 約13小時 約19小時
2 × 100 bp   約21小時 約33小時
2 × 150 bp 約19小時 約29小時 約48小時
2 × 300 bp 約34小時 約44小時  

* 質量分值(Q值)是對堿基檢出中錯誤發(fā)生幾率的預測。>Q30的堿基百分比根據(jù)整個運行中的數(shù)據(jù)取平均值。質量分值是基于NextSeq試劑盒在NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN系統(tǒng)上的運行所計算的,利用了Illumina PhiX對照文庫。根據(jù)文庫類型和質量、插入片段大小、上樣濃度及其他實驗因素的不同,性能表現(xiàn)可能有所差異。
† 運行時間包括NextSeq 1000/1000-CN或NextSeq 2000/2000-CN系統(tǒng)上的簇生成、測序和堿基檢出。
‡ P3試劑僅適用于NextSeq 2000/2000-CN系統(tǒng)。

 

對關鍵應用估計的樣本通量*

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN
流動槽類型 P1 P2 P3 
小型全基因組測序(300個循環(huán))
130 Mb基因組;覆蓋度大于30倍
~7 ~30 ~90
小型全基因組測序(600個循環(huán))
130 Mb基因組;覆蓋度大于30倍
~12 ~36
全外顯子組測序(200個循環(huán))
平均目標區(qū)域覆蓋度為50倍;90%的目標區(qū)域覆蓋度為20倍
~4 ~16 ~48
總RNA-Seq(200個循環(huán)) §
每個樣本50M read對
~2 ~16 ~24
mRNA-Seq(200個循環(huán))§
每個樣本25M read對
~4 ~32 ~48
單細胞RNA-Seq(100個循環(huán))**
5K細胞,20K reads/細胞
1†† ~4 ~11
miRNA-Seq或小RNA分析(50個循環(huán))
11M reads/樣本
~9‡‡ 36§§ ~108
16S RNA測序(600個循環(huán)) ~384*** ~384***

* 表格數(shù)據(jù)代表每次運行預計樣本數(shù)。
 P3試劑僅適用于NextSeq 2000/2000-CN系統(tǒng)。
 使用P1 300個循環(huán)試劑盒。
§ 對于Illumina Stranded Total RNA Prep和Illumina Stranded mRNA Prep,建議讀長是2 × 75 bp,對于Illumina RNA Prep with Enrichment建議讀長是2 × 100 bp。
** 建議的測序深度在很大程度上取決于樣本類型和實驗目標,需要針對每項研究進行優(yōu)化。
†† P1試劑是單細胞質量控制實驗的好選擇。
‡‡ 使用P1 100個循環(huán)試劑盒。
§§ 使用P2 100個循環(huán)試劑盒。
*** 因美納提供最多384個唯一雙標簽序列。

 

Sequencing output per flow cella

NextSeq 1000 and NextSeq 2000
Flow cell type P1b P2b P3b,c P4c
1 × 50 bp       90 Gb
2 × 50 bp 10 Gb 40 Gb 120 Gb 180 Gb
2 × 100 bp   80 Gb 240 Gb 360 Gb
2 × 150 bp 30 Gb 120 Gb 360 Gb 540 Gb
2 × 300 bp 60 Gb 240 Gb    

a. Output specifications are based on an Illumina PhiX control library at supported cluster densities.
b. XLEAP-SBS reagents for P1, P2, and P3 flow cells available Q2 of 2024.
c. P3 and P4 reagents are available for the NextSeq 2000 System only.

 

Shelf life

NextSeq 1000 and NextSeq 2000
Item Storage Temperature P1, P2, P3 Shelf Lifea P4 Shelf Lifeb
Cartridge -25°C to -15°C 6 months 3 months
Flow Cell 2°C to 8°C 6 months 3 months
RSB with Tween 20c 2°C to 8°C 6 months 6 months

a. P1, P2, and P3 with XLEAP-SBS chemistry will launch in Q2 of 2024 with a shelf life of 6 months.
b. In 1H of 2024, P4 shelf life will be 3 months. This will be extended to 6 months in 2H of 2024.
c. Shipped at room temperature.

 

Reads passing filter per flow cell

NextSeq 1000 and NextSeq 2000 with XLEAP-SBS chemistry
Flow Cell Type P1a P2a P3a,b P4b
Single-end Reads 100M 400M c 1.2B 1.8B
Paired-end Reads 200M 800M d 2.4B 3.6B

a. XLEAP-SBS reagents for P1, P2, and P3 flow cells available Q2 of 2024.
b. P3 and P4 reagents are available for the NextSeq 2000 System only.
c. 300M single-end reads for 2 × 300 bp with standard SBS chemistry. 400M single-ends reads for 2 x 300 bp with XLEAP-SBS chemistry.
d. 600M paired-end reads for 2 × 300 bp with standard SBS chemistry. 800M single-ends reads for 2 x 300 bp with XLEAP-SBS chemistry.

 

Quality scores and run time

NextSeq 1000 and NextSeq 2000 with XLEAP-SBS chemistry
Flow cell type P1a P2a P3a,b P4b
Quality scoresc
1 × 50 bp ≥ 90% of bases higher than Q30
2 × 50 bp ≥ 90% of bases higher than Q30
2 × 100 bp ≥ 90% of bases higher than Q30
2 × 150 bp ≥ 90% of bases higher than Q30
2 × 300 bp ≥ 85% of bases higher than Q30
Run timed
1 × 50 bp       12 hr
2 × 50 bp 8 hr 12 hr 18 hr 20 hr
2 × 100 bp   19 hr 31 hr 34 hr
2 × 150 bp 17 hr 22 hr 40 hr 44 hr
2 × 300 bp 34 hr 42 hr    

a. XLEAP-SBS reagents for P1, P2, and P3 flow cells available Q2 of 2024.
b. P3 and P4 reagents are available for the NextSeq 2000 System only.
c. Quality scores are based on an Illumina PhiX control library; performance may vary based on library type and quality, insert size, loading concentration, and other experimental factors.
d. Run time includes cluster generation, sequencing, and base calling on a NextSeq 1000 or NextSeq 2000 System.

 

Estimated sample throughput for key applicationsa

NextSeq 1000 and NextSeq 2000 with XLEAP-SBS chemistry
Flow Cell Type P1b P2b P3b,c P4c
Small Whole-Genome Sequencing (300 cycles)
130 Mb genome; > 30× coverage
7 30 92 138
Whole-Exome Sequencing (200 cycles)
~8 Gb per exome, 90× mean coverage
~2d 10 30 45
Total RNA-Seq (200 cycles)
50M read pairs per sample
2d 8 24 36
mRNA-Seq (200 cycles)
25M read pairs per sample
4d 16 48 72
Single-Cell RNA-Seq (100 cycles)
5K cells, 20K reads/sample
1e 4 12 48
miRNA-Seq or Small RNA Analysis (50 cycles)
11M reads/sample
9f 36f 108f 163
16S RNA sequencing (600 cycles) 384g 384g    

a. Table values represent estimated number of samples per run. Recommended sequencing depth will largely depend on sample type and experimental objective and will need to be optimized for each study.
b. XLEAP-SBS reagents for P1, P2, and P3 flow cells available Q2 of 2024.
c. P3 and P4 reagents are available for the NextSeq 2000 System only.
d. Use P1 300-cycle kit.
e. P1 reagents are a good option for single-cell quality control experiments.
f. Use 100-cycle kits.
g. A maximum of 384 unique dual indexes is available from Illumina.

 

 

 

 

 

 

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN
儀器規(guī)格表

儀器配置
  • 具有集成式DRAGEN Bio-IT FPGA二級分析的獨立干燥儀器

    儀器控制計算機
    操作環(huán)境
    激光
    尺寸
    包裝尺寸
    電源要求
    網(wǎng)絡連接帶寬
    產(chǎn)品安全與合規(guī)
    • 安全性:1級激光產(chǎn)品

    • NRTL認證IEC

    • 61010-1 CE認證

    • FCC/IC批準

    • 內部網(wǎng)絡上傳速度:200 Mb/s/儀器

    • BaseSpace Sequence Hub上傳速度:200 Mb/s/儀器

    • 儀器操作數(shù)據(jù)上傳速度:5 Mb/s/儀器

    • 儀器輸入電壓:100 V到240 V交流電

    • 儀器輸入頻率:50/60 Hz

    • 包裝寬×深×高:92 cm × 120 cm × 118 cm

    • 毛重:232 kg

    • 寬x深x高:60 cm × 65 cm × 60 cm

    • 重量:141 kg

    • 波長:449 nm、523 nm、820 nm

    • 溫度:15°C-30°C

    • 濕度:相對濕度20%–80%,非冷凝

    • 海拔:0–2000米

    • 僅供室內使用

    • 主機:位于儀器內部的2U微型服務器

    • 內存:288 GB

    • 硬盤:3.8 TB SSD

    • 操作系統(tǒng):Linux CentOS 7.6

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